樱田纯，一名不愿上学而长期不出家门的中学生，热衷于上网购物，喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。有一天收到一封自称是人工精灵崛江的来信，上面只写一个发条 还是 不发条的选项，在好奇心驱使下选择了转动发条，之后房间就出现了一个没有署名的神秘皮箱，里面装着一个非常美丽而且质感近似真人的少女人偶（），使用木箱内的发条转动背部的开关后，人偶像有生命般的活动起来，向纯说：我是真红，蔷薇少女第五人偶。突然一个小丑布偶来袭，纯在万般无奈下在不明白怎么回事的情况下糊里糊涂地成为了真红的媒介，结下了主仆关系。之后，一个结下类似契约的人类和娃娃出现在纯和真红面前，被称为Rozen Maiden（蔷薇少女） 的人偶们战斗就此展开了…… 由人气漫画家PEACHPIT原作的漫画作品蔷薇少女，以“不可思议的幻想沉醉世界”为号召，的确是不可思议的唯美与神秘。

　　某一日，对生活毫无干劲，只知道在网上购物的颓废男樱田纯（真田麻美 配音）收到了一封写着“上发条”和“不上发条”的信，好奇的他选择了前者，没想到，就因为这无意中的选择，一个充满神奇和争斗的残酷世界向他打开了大门。 
名叫真红（泽城美雪 配音）的人偶出现在了纯的面前。原来，在百年之前，人偶制造的技术由于“蔷薇圣母”的发现而突飞猛进，于是，7个有自己的意识和思维的人偶诞生了。可是，制造者并不满足于此，他希望能够制作出最完美的人偶——爱丽丝，而怀着对制造者的爱，一场激烈的，夺取蔷薇圣母成为完美爱丽丝的战争在7个人偶之间展开。此时，新一轮的争夺即将开始，作为真红的新主人，纯会开始怎样惊险的冒险呢？